Идентификация популяций Habrobracon hebetor  по RAPD-маркерам

Установлено, что пищевые предпочтения и условия разведения лабораторных популяций габробракона H.hebetor значительно варьируют. В связи с этим необходима идентификация популяций внутри изучаемого вида с использованием ДНК-маркеров – эффективного и достоверного средства для оценки генетических различий между выборками данного вида насекомых. Проведен молекулярно-генетический анализ двух различных географических популяций энтомофага Habrobraconhebetor (из Краснодара, Россия и Чимкента, Казахстан) по RAPD-маркерам; 21 RAPD-праймер протестирован на специфичность по отношению к ДНК H.hebetor. Выявлены пять RAPD-праймеров (ОРА05, ОРА10, ОРВ01, ОРВ04, UBC519), обладающих высокой специфичностью и способностью дифференцировать популяции H.hebetor. Определены ДНК-маркеры, специфические для краснодарской и чимкентской популяции энтомофага, позволяющие четко их идентифицировать: для краснодарской – RAPD-маркеры с молекулярной массой 550 п.н. (UBC519), 500 и 700 п.н. (ОРА05), 1100, 1200 и 1300 п.н. (ОРА10), 220 и 800 п.н. (ОРВ04), 880 п.н. (ОРВ01); для чимкентской – 400, 600 и 1200 п.н. (UBC519), 600 и 950 п.н. (ОРА10, 800 п.н. (ОРВ01). Сделан вывод о том, что данные RAPD-праймеры можно использовать для идентификации и дифференциации других популяций H.hebetor.

Ключевые слова

ПЦР, RAPD-анализ, праймер, насекомые, Habrobracon hebetor, популяция, ДНК-полиморфизм, генетическое разнообразие

Источник финансирования

Работа выполнена при финансовой поддержке гранта № 16-44-230520 Российского фонда фундаментальных исследований и администрации Краснодарского края.

Получено

17.08.2018

Дата публикации

30.09.2018

Кол-во символов

1282

Цитировать Скачать pdf Для скачивания PDF необходимо авторизоваться

ГОСТ	Киль В. И. , Агасьева И. С. , Беседина Е. Н. , Балабан А. Т. , Исмаилов В. Я. Идентификация популяций Habrobracon hebetor по RAPD-маркерам // Российская сельскохозяйственная наука – 2018. – Номер 4 C. 36-39 [Электронный ресурс]. URL: http://ras.jes.su/rshn/s207987840000481-8-1 (дата обращения: 25.04.2024). DOI: 10.31857/S250026270000546-5
MLA	Kil, V., Agasieva, I., Besedina, E., Balaban, A., Ismailov, V. "Identification of Habrobracon hebetor populations with RAPD markers." Rossiiskaia selskokhoziaistvennaia nauka 4 (2018):36-39. DOI: 10.31857/S250026270000546-5
APA	Kil V., Agasieva I., Besedina E., Balaban A., Ismailov V. (2018). Identification of Habrobracon hebetor populations with RAPD markers. Rossiiskaia selskokhoziaistvennaia nauka (4), pp.36-39 DOI: 10.31857/S250026270000546-5

Другие версии

S250026270000546-5-1 Дата внесения исправлений в статью - 30.09.2018

Размещенный ниже текст является ознакомительной версией и может не соответствовать печатной.

всего просмотров: 2351

Оценка читателей: голосов 0

1. Исмаилов В.Я., Агасьева И.С., Киль В. И., Федоренко Е. В., Беседина Е. Н., Нефедова М. В. Изучение биологических особенностей эктопаразита HabrobraconhebetorSay в целях оптимизации биоценотической регуляции численности вредных чешуекрылых // Наука Кубани. – 2017. – № 4. – С. 26-33.

2. Агасьева И.С., Исмаилов В.Я., Киль В.И., Федоренко Е.В., Беседина Е.Н., Кувика Т.О., Нефедова М.В. Изучение биологических особенностей популяций эктопаразита Habrobraconhebetor SAY (Hymenoptera, Braconidae) для биологической защиты растений // Материалы Межд. научно-практической конф. «Биологическая защита растений - основа стабилизации агроэкосистем» с молодежной стратегической сессией «Кадры, ресурсы, возможности, инновации». Выпуск 9, 20-22 сентября 2016 г., Краснодар, С.106-111.

3. WilliamsJ.G.K., KubelikA.R., LivakK.J. etal. DNA polymorphism's amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucl. AcidsRes. 1990.– V. 18. –P. 6531-6535.

4. Киль В.И. Использование высокоспецифических RAPD-праймеров для ПЦР-анализа популяций вредных и полезных насекомых // Доклады Россельхозакадемии. – 2014. – №6. – С.21-25.

5. Antolin M. F., Bosio C. F., Cotton J., Sweeney W., Strand M. R., Black W.C. Intensive Linkage Mapping in a Wasp (Braconhebetor) and a Mosquito(Aedesaegypti) With Single-Strand Conforma-tion Polymorphism Analysis of Random Amplified Polymorphic DNA Markers // Genetics 145. (August, 1996). – P. 1727-1738.

6. Holloway A.K., Heimpel G. E., Strand M.R., Antolin M.F. Survival of Diploid Males in Braconsp. near hebetor(Hymenoptera: Braconidae) // Ann. Entomol. Soc. Am. 92(1).– 1999. – P.110-116.

7. Holloway A.K., Strand M.R., Black W.C. IV, Antolin M.F. Linkage Analysis of Sex Determination in Braconsp. Nearhebetor (Hymenoptera: Braconidae) // Genetics 154. (January 2000). – P.205–212.

8. Antolin MF, Ode PJ, Heimpel GE, O'Hara RB, Strand MR. Population structure, mating system, and sexdeterminingallele diversity of the parasitoid wasp Habrobraconhebetor // Heredity.– 2003. – 91. – Р.373–381.

9. Киль В.И., Беседина Е.Н., Агасьева И.С., Исмаилов В.Я. ДНК полиморфизм и генетическое разнообразие краснодарской популяции Habrobracon hebetor // Wschodnioeuropejskie Czasopismo Naukowe (East European Scientific Journal). – 2016. – N 12. – P.49-51.

10. Киль В.И., Беседина Е.Н., Агасьева И.С., Исмаилов В.Я. RAPD-анализ лабораторной и природной популяций Habrobracon hebetor // Scientific symposium (IV-th edition) «Advanced Biotechnologies - Achievements and Prospects, in October 3-4, 2016 in Chisinau, Republic of Moldova, P.11.

11. Киль В.И., Балабан А.Т. ПЦР-анализ эктопаразита Habrobraconhebetor по RAPD- и ISSR-маркерам // В сборнике: Современные проблемы науки, технологий, инновационной деятельности. Сборник научных трудов по материалам Межд. научно-практической конф. В 4-х частях. / Под общей редакцией Е.П. Ткачевой. – Белгород, 2017. – С. 18-20.

12. Киль В.И. Методика оценки ДНК полиморфизма популяций насекомых с помощью ПЦР (RAPD- и ISSR-PCR) // Методические рекомендации. – Краснодар: ООО «Просвещение-Юг», 2009. – 16 с.

13. Van de Peer, Y., De Wachter, R. Construction of evolutionary distance trees with TREECON for Windows: accounting in nucleotide substitution rate among sites. // Comput. Applic.Biosci.– 1997. – 13. – P.227-230.

14. Yeh F.C. Yang R.C., Boyle T.B.J., Ye Z.H., Mao J.X. POPGENE, the user-friendly shareware for population genetic analysis. Computer program and documentation // Molecular Biology and Biotechnology Centre. University of Alberta, Edmonton, 1997.