Идентификация и анализ вариабельности генов-гомологов биосинтеза L-аскорбиновой кислоты VТC2 у видов томата (Solanum секция Lyco-persicon)

 
Код статьиS086956520003457-5-1
DOI10.31857/S086956520003457-5
Тип публикации Статья
Статус публикации Опубликовано
Авторы
Аффилиация: Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" РАН
Адрес: Российская Федерация
Аффилиация:
Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" РАН
МГУ им. М.В. Ломоносова
Адрес: Российская Федерация
Аффилиация:
Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" РАН
МГУ им. М.В. Ломоносова
Адрес: Российская Федерация
Название журналаДоклады Академии наук
ВыпускТом 483 Номер 6
Страницы682-686
Аннотация

Определены и охарактеризованы нуклеотидные последовательности генов-гомологов ГДФ-L-галактозо-фосфорилазы-1 (VTC2) у 11 видов томата (Solanum секция Lycopersicon). Общий уровень нуклеотидной вариабельности составил 9,19%. Из 54 SNPs в экзонах 25 приводили к замещениям аминокислот. У зелёноплодных видов обнаружили большее количество замен, чем у красноплодных, но процент несинонимичных замен у красноплодных был выше (66,7% vs 37,5%). В составе аминокислотных последовательностей выявили наличие домена ГДФ-L-галактозо-гексоз-1-фосфат-гуанилтрансферазы, высококонсервативного мотива HIT и наличие мотива, специфичного для Solanoideae.

Ключевые слова
Источник финансированияРабота выполнена на научном оборудовании ЦКП “Биоинженерия” с использованием экспериментальной установки искусственного климата при финансовой поддержке гранта РФФИ 18–316–00033.
Получено26.12.2018
Дата публикации26.12.2018
Цитировать   Скачать pdf Для скачивания PDF необходимо авторизоваться
Размещенный ниже текст является ознакомительной версией и может не соответствовать печатной.

всего просмотров: 1115

Оценка читателей: голосов 0

1. Yang D., Meng L., Ma N., Yang X., Meng Q. // Plant Physiology and Biochemistry 2017. V. 112. Article 218e226.

2. Pavet V., Olmos E., Kiddle G., Mowla S., Kumar S., Antoniw J., Alvarez M.E.,Foyer C.H. // Plant Physiol. 2005. V. 139. Article 1291e1303.

3. Garchery C., Gest N., Do P.T., Alhagdow M., Baldet P., Menard G., Rothan C., Massot C., Gautier H., Aarrouf J., et al. // Plant Cell Environ. 2013. V. 36. Article 159e175.

4. Barth C., De Tullio M., Conklin P.L. // J. Exp. Bot. 2006. V.57 Article 1657e1665.

5. Giovannoni J. // PNAS. 2007. V. 104.№ 22. P. 9109-9110

6. Linster C.L., Clarke S.G. // Trends in plant science. 2008. V. 13. № 11. P. 567 - 573.

7. Oguz T., Cantug B., Bilal O., Duygu Y. O., Dane R., Nilufer T., Anne F., Sami D. // Hort Science. 2014. V. 49. P. 1003 - 1009.

8. Edwards K., Johnstone C., Thompson C. // Nucleic Acids Res. – 1991. – V.19. – №6. – P. 1349.

9. Slugina M.A., Shchennikova A.V., Kochieva E.Z. // Mol Genet Genomics. 2017. V. 292. № 5. 1123 - 1138.

10. Slugina M.A., Shchennikova A.V., Kochieva E.Z. // Plant molecular biology reporter. 2018. https://doi.org/10.1007/s11105-018-1071-5

11. 100 Tomato Genome Sequencing Consortium // Plant J. 2014. V. 80. № 1. P. 136 - 148.

12. Peralta I.E., Spooner D.M., Knapp S. // Systematic Botany Monographs. 2008. V.84. P. 1-186.

13. Hou H.M., Li H.E., Gao M., Wang H., Jiao C., Wang X.P. // Genet Mol Res. 2013. V. 12. № 3. P. 3830 - 3844.

14. Krakowiak A., Fryc I. // Postepy Biochem. 2012 V. 58. № 3. P. 302 - 313.

15. Bailey T.M., Boden M., Buske F.A., Frith M., Grant C. E., Clementi L., Ren J., Li W.W., Noble W.S. // Nucleic Acids Research. 2009. V. 37. P. 202 -208.

Система Orphus

Загрузка...
Вверх