Вновь о соотнесенности языка и генетического кода

С самого начала зарождения генетики было осознано глубинное сходство между языком и процессами обработки и передачи генетической информации. Еще в 1970 г. Р. Якобсон сформулировал проблему соответствий между языком и генетическим кодом как кардинальную для лингвистики. Были предприняты попытки дешифровки кодирующих белки нуклеодидных последовательностей. Однако они не привели к существенным результатам, поскольку эти методики были слабо связаны с методами современной лингвистики, они ограничивались процессами декодирования, что в лучшем случае позволяет составить словарь единиц, но не описать язык и выявить определяющие для коммуникации структуры смысла и текста. Так, до сих пор остаются невыясненными функции порядка 90% некодирующих последовательностей ДНК. В должной мере не учитывалось то, что только текст (а не знак) может рассматриваться как объект процесса создания — передачи — сохранения — преобразования информации.

Между тем новейшие открытия показали возможность управления трансгенной экспрессией посредством мыслительной деятельности, что подтверждает необходимость рассматривать процессы обработки генетической информации как коммуникацию. Предлагается рассматривать геном как гипертекст, состоящий из упорядоченного подмножества других текстов. Текст может быть рассмотрен как квазиорганизм, обладающий памятью, креативно-когнитивными характеристиками и коммуникативным потенциалом, а клетка (ее рибосома) — как обладающая квазиинтеллектом и способностью оперировать абстрактными семиотическими последовательностями. В качестве фрагмента подобного описания мы предлагаем рассмотреть синтез белка (генетическую трансляцию) как лингво-семиотический процесс, показав, что «чтение» клеткой генетической информации разделяет сущностные характеристики «чтения» текста человеком. Предварительные результаты позволяют углубить отмеченные еще Р. Якобсоном фундаментальные характеристики, сближающие язык и генетический код, и добавить новые: аналог дихотомии языка и речи, знаковый характер генетической информации (наличие означающего и означаемого), разграничение между знаком в системе (type) и в тексте (token).

Ключевые слова

генетическая трансляция, генетический код, геном, гипертекст, текст как квазиорганизм

Получено

25.01.2016

Дата публикации

25.01.2016

Кол-во символов

2157

Цитировать

ГОСТ	Золян С. Т. Вновь о соотнесенности языка и генетического кода // Вопросы языкознания – 2016. – Номер 1 C. 114-132 [Электронный ресурс]. URL: http://ras.jes.su/vopjaz/s207987840000045-8-2 (дата обращения: 23.05.2024).
MLA	Zolyan, Suren T "Rethinking the correlations between language and genetic code." Voprosy Jazykoznanija 1 (2016):114-132.
APA	Zolyan S. (2016). Rethinking the correlations between language and genetic code. Voprosy Jazykoznanija (1), pp.114-132

100 руб.

При оформлении подписки на статью или выпуск пользователь получает возможность скачать PDF, оценить публикацию и связаться с автором. Для оформления подписки требуется авторизация.

Оператором распространения коммерческих препринтов является ООО «Интеграция: ОН»

Всего подписок: 3, всего просмотров: 746

Оценка читателей: голосов 0

1. Бенвенист 1974 — Бенвенист Э. Общая лингвистика. М.: Прогресс, 1974. [Benveniste E. Obshchaya lingvistika [General linguistics]. Moscow: Progress, 1974].

2. Гамкрелидзе 1988 — Гамкрелидзе Т. В. Р. О. Якобсон и проблема изоморфизма между генетическим кодом и семиотическими системами // Вопросы языкознания. 1988. № 3. С. 5—9. [Gamkrelidze T. V. R. O. Jakobson and the problem of isomorphism between the genetic code and semiotic systems. Voprosy Jazykoznanija. 1988. No. 3. Pp. 5—9.]

3. Гаряев 2009 — Гаряев П. П. Лингвистико-волновой геном. Киев: Ин-т квантовой генетики, 2009. [Garyaev P. P. Lingvistiko-volnovoi genom [Linguistic wave genome]. Kiev: The Institute of quantum genetics, 2009.]

4. Гельфанд 1990 — Гельфанд М. С. Коды генетического языка и естественный язык // Вопросы языкознания. 1990. № 6. С. 60—70. [Gelfand M. S. Codes of genetic language and natural language. Voprosy jazykoznanija. 1990. No. 6. Pp. 60—70.]

5. Ельмслев 1960 — Ельмслев Л. Пролегомены к теории языка // Новое в лингвистике. Вып. 1. М.: Прогресс, 1960. С. 264—389. [Hjelmslev L. Prolegomena to the theory of language. Novoe v lingvistike. No. 1. Moscow: Progress, 1960. Pp. 264—389.]

6. Жакоб 1992 — Жакоб Ф. Лингвистическая модель в биологии // Вопросы языкознания. 1992. № 2. С. 135—141. [Jakob F. The linguistic model in biology. Voprosy jazykoznanija. 1992. No. 2. Pp. 135—141.]

7. Золян 2013 — Золян С. Т. «Бесконечный лабиринт сцеплений»: семантика текста как многомерная структура // Критика и семиотика. 2013. № 1 (18). С. 18—44. [Zolyan S. T. «The endless labyrinth of connections»: Text semantics as a multidimensional structure. Kritika i semiotika. 2013. No. 1 (18). Pp. 18—44.]

8. Золян 2014 — Золян С. Т. О референциальной и когнитивной семантике текста // Иностранные языки в высшей школе. 2014. № 3 (30). С. 5—19. [Zolyan S. T. On referential and cognitive semantics of the text. Inostrannye yazyki v vysshei shkole. 2014. No. 3 (30). Pp. 5—19.]

9. Золян 2015 — Золян С. Т. О словоцентричных и текстоцентричных лингвистических описаниях // Язык. Общество. История науки. К 70-летию В. М. Алпатова. Тезисы докл. Межд. конф. М.: Ин-т востоковедения РАН, 2015. С. 46—48. [Zolyan S. T. On word-centered and text-centered linguistic descriptions. Yazyk. Obshchestvo. Istoriya nauki. K 70-letiyu V. M. Alpatova. Tezisy dokladov Mezhdunarodnoi konferentsii. Moscow: Institute of Oriental Studies, Russian Academy of Sciences, 2015. Pp. 46—48.]

10. Иванов 2010 – Иванов Вяч. Вс. «Границы семиотики»: вопросы к предварительному обсуждению // Современная семиотика и гуманитарные науки. М.: Языки славянских культур, 2010. С. 31—50. [Ivanov V. V. «The frontiers of semiotics»: Questions for a preliminary discussion. Sovremennaya semiotika i gumanitarnye nauki. Moscow: Yazyki Slavyanskikh Kul’tur, 2010. Pp. 31—50.]

11. Инге-Вечтомов 1996 — Инге-Вечтомов С. Г. Трансляция как способ существования, или в чем смысл «бессмысленных» кодонов // Соросовский образовательный журнал. Биология. 1996. № 12. С. 2—10. [Inge-Vechtomov S. G. Translation as a mode of existence, or What’s the use of «senseless» triplets. Sorosovskii obrazovatel’nyi zhurnal. Biologiya. 1996. No. 12. Pp. 2—10.]

12. Крик, Ниренберг 1964 — Крик Ф., Ниренберг М. Генетический код // Успехи физических наук. 1964. Т. LXXXII. Вып. 1. С. 133—160. [Сrick F. Н., Nierenberg M. W. The genetic code. Uspekhi fizicheskikh nauk. 1964. Vol. LXXXII. No. 1. Pp. 133—160.]

13. Лотман М. 1985 — Лотман М. Ю. Двойственная природа текста (связный текст как семиотическое и коммуникативное образование) // Текст и культура: общие и частные проблемы. М.: Ин-т языкознания АН СССР, 1985. С. 3—20. [Lotman M. Yu. The dualistic nature of the text (discourse as a semiotic and communicative entity). Tekst i kul’tura: obshchie i chastnye problemy. Moscow: Institute of Linguistics, Academy of Sciences of the USSR, 1985. Pp. 3—20.]

14. Лотман Ю. 1981а — Лотман Ю. М. Мозг — текст — культура — искусственный интеллект // Семиотика и информатика. Вып. 17. М: ВИНИТИ, 1981. С. 13—17. [Lotman Yu. M. Brain — text — culture — artificial intelligence. Semiotika i informatika. No. 17. Moscow: All-Union Institute of Scientific and Technical Information, 1981. Pp. 13—17.]

15. Лотман Ю. 1981б — Лотман Ю. М. Семиотика культуры и понятие текста // Учен. зап. Тартуского гоc. ун-та. 1981. Вып. 515. С. 8—28. [Lotman Yu. M. Semiotics of culture and the concept of the text. Uchenye zapiski Tartuskogo gosudarstvennogo uiversiteta. 1981. No. 515. Pp. 8—28.]

16. Лотман Ю. 1982 — Лотман Ю. М. От редакции: (О семиотическом подходе к проблеме межтекстовых отношений) // Учен. зап. Тартуского гоc. ун-та. Вып. 576. (Труды по знаковым системам. Т. 15.) С. 3—9. [Lotman Yu. M. Editorial note: (On a semiotic approach to the problem of intertextual relations). Uchenye zapiski Tartuskogo gosudarstvennogo uiversiteta. No. 576. (Trudy po znakovym sistemam. Vol. 15.). Pp. 3—9.]

17. Лотман Ю. 1984 — Лотман Ю. М. О семиосфере // Учен. зап. Тартуского гоc. ун-та. 1984. Вып. 641. (Труды по знаковым системам. [Т.] 17.) С. 5–23. [Lotman Yu. M. On semiosphere. Uchenye zapiski Tartuskogo gosudarstvennogo uiversiteta. 1984. No. 641. (Trudy po znakovym sistemam. [Vol.] 17.) Pp. 5–23.]

18. Николаева 1977 — Николаева Т. М. Лингвистика текста и проблемы общей лингвистики // Известия Академии наук СССР. Серия литературы и языка. 1977. Т. 36. № 4. С. 304—313. [Nikolaeva T. M. Text linguistics and the problems of general linguistics. Izvestiya Akademii nauk SSSR. Seriya literatury i yazyka. 1977. Vol. 36. No. 4. Pp. 304—313.]

19. Николаева 1978 — Николаева Т. М. Лингвистика текста: Современное состояние и перспективы // Новое в зарубежной лингвистике. Вып. 8. М.: Прогресс, 1978. С. 5—42. [Nikolaeva T. M. Text linguistics: Current status and prospects. Novoe v zarubezhnoi lingvistike. No. 8. Moscow: Progress, 1978. Pp. 5—42.]

20. Николаева 2015 — Николаева Т. М. О «лингвистике речи» (в частности, о междометии) // Вопросы языкознания. 2015. № 4. С. 7—20. [Nikolaeva T. M. On the «linguistics of speech». Voprosy jazykoznanija. 2015. No. 4. Pp. 7—20.]

21. Ратнер 1965 — Ратнер В. А. Генетические управляющие системы. Автореф. дис. ... канд. биол. наук. АН СССР, Сибирское отделение, Объединенный совет по биологическим наукам. Новосибирск, 1965. [Ratner V. A. Geneticheskie upravlyayushchie sistemy. Avtoref. kand. diss. [Genetic control systems. Author’s abstract of the cand. diss.] Academy of Sciences of the USSR, Siberian Branch, Joint Council for Biological Sciences. Novosibirsk, 1965.]

22. Ратнер 1993а — Ратнер В. А. Генетический язык: грамматика, предложения, эволюция // Генетика. 1993. № 29. С. 709—719. [Ratner V. A. Genetic language: Grammar, sentences, evolution. Genetika. 1993. No. 29. Pp. 709—719.]

23. Ратнер 1993б — Ратнер В. А. Сравнительная иерархическая структура генетического языка. // Генетика. 1993. № 29. С. 720—739. [Ratner V. A. The comparative hierarchic structure of the genetic language. Genetika. 1993. No. 29. Pp. 720—739.]

24. Ратнер 2000 — Ратнер В. А. Генетический код как система // Соросовский образовательный журнал. Биология. 2000. Т. 6. № 3. С. 17—22. [Ratner V. A. Genetic code as a system. Sorosovskii obrazovatel’nyi zhurnal. Biologiya. 2000. Vol 6. No. 3. Pp. 17—22.]

25. Седов 2000 — Седов А. Е. Метафоры в генетике // Вестник Российской академии наук. 2000. Т. 70. № 6. C. 526—534. [Sedov A. E. Metaphors in genetics. Vestnik Rossiiskoi akademii nauk. 2000. Vol. 70. No. 6. Pp. 526—534.]

26. Седов 2001 — Седов А. Е. Иерархические концепции и междисциплинарные связи генетики, запечатленные в ее метафорах: количественный и структурный анализ терминов и высказываний // Науковедение. 2001. № 1. С. 135—154. [Sedov A. E. Hierarchic conceptions and cross-disciplinary connections of genetics embedded in its metaphors: Quantitative and structural analysis of terms and utterances. Naukovedenie. 2001. No. 1. Pp. 135—154.]

27. Соловьев и др. 1988 — Соловьев В. В., Кель А. Э., Рогозин И. Б., Колчанов Н. А. Использование ЭВМ в молекулярной биологии. Введение в теорию генетических текстов. Новосибирск: Новосибирский ун-т, 1988. [Solov’ev V. V., Kel’ A. E., Rogozin I. B., Kolchanov N. A. Ispol’zovanie EVM v molekulyarnoi biologii. Vvedenie v teoriyu geneticheskikh tekstov [The use of computers in molecular biology. Introduction to the theory of genetic texts]. Novosibirsk: Novosibirsk Univ., 1988.]

28. Степанов 1971 — Степанов Ю. С. Семиотика. М.: Наука, 1971. [Stepanov Yu. S. Semiotika [Semiotics]. Moscow: Nauka, 1971.]

29. Шредингер 2002 — Шредингер Э. Что такое жизнь? Физический аспект живой клетки. М.; Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2002. [Schrödinger E. Chto takoe zhizn’? Fizicheskii aspekt zhivoi kletki [What is life? Physical aspect of the living cell]. Moscow; Izhevsk: Scientific Research Center «Regular and chaotic dynamics», 2002.]

30. Чебанов 2004 — Чебанов С. Российская биосемиотика как школа: проблема институализации. Научные чтения - 2003. Материалы конф. СПб.: Филологический ф-т СПбГУ, 2004. С. 164—171. [Chebanov S. Russian biosemiotics as a school: The problem of institualization. Nauchnye chteniya - 2003. Materialy konferentsii. St. Petersburg: Philological Department of St. Petersburg State Univ., 2004. Pp. 164—171.]

31. Якобсон 1985 — Якобсон Р. Лингвистика в ее отношении к другим наукам // Якобсон Р. Избранные работы. М.: Прогресс, 1985. С. 387—404. [Jakobson R. Linguistics in its relation to other sciences. Jakobson R. Izbrannye raboty. Moscow: Progress, 1985. Pp. 387—404.]

32. Augustyn 2013 — Augustyn P. What connects Biolinguistics and Biosemiotics? Biolinguistics. 2013. Vol. 7. Pp. 96—111.

33. Barbieri 2007a — Barbieri M. (ed.). Introduction to Biosemiotics. The new biological synthesis. Dordrecht: Springer, 2007.

34. Barbieri 2007b — Barbieri M. Is the cell a semiotic system? Introduction to Biosemiotics. The new biological synthesis. Barbieri M. (ed.). Dordrecht: Springer, 2007. Pp. 179—208.

35. Barbieri 2008a — Barbieri M. What is Biosemiotics? Biosemiotics. 2008. Vol. 1. Pp. 1—3.

36. Barbieri 2008b — Barbieri M. Biosemiotics: A new understanding of life. Naturwissenschaften. Dordrecht: Springer, 2008. Pp. 577—599.

37. de Beaugrande, Dressler 1981 — de Beaugrande R. A., Dressler W. U. Introduction to text linguistics. London: Longman, 1981.

38. Bickerton 2014 — Bickerton D. Some problems for Biolinguistics. Biolinguistics. 2014. Vol. 8. Pp. 73—96.

39. Collins 2006 — Collins F.S. The language of God. New York: Free Press, 2006.

40. Collins 2009 — Collins F.S. The language of life: DNA and the revolution in personalized medicine. New York: Harper-Collins, 2009.

41. Crick 1966 — Crick F. The genetic code — yesterday, today and tomorrow. Cold spring symposium on quantitative Biology. 1966. Vol. 31. Pp. 3—9.

42. Crick 1981 — Crick F. Life Itself: Its origin and nature. London: Simon and Schuster, 1981.

43. Dijk 1972 — Dijk T. van. Some aspects of text grammars. A study in theoretical poetics and linguistics. The Hague: Mouton, 1972.

44. Emmeche, Hoffmeyer 1991 — Emmeche C, Hoffmeyer J. From language to nature — the semiotic metaphor in biology. Semiotica. 1991. Vol. 84 (1/2). Pp. 1—42.

45. Elumalai, Eswaraiah 2013 — Elumalai, Eswaraiah M. Review on application of bioinformatics. Journal of Science. Bioinformatics. 2013. Vol. 3 (1). Pp. 21—27.

46. Folcher M. et al. 2014 — Folcher M. et al. Mind-controlled transgene expression by a wireless-powered optogenetic designer cell implant. Nature communication. 2014. Vol. 5. No. 5392.

47. Favareau 2007 — Favareau D. The evolutionary history of biosemiotics. Introduction to Biosemiotics. The new biological synthesis. Barbieri M. (ed.). Dordrecht: Springer, 2007. Pp. 1—69.

48. Fox Keller 2002 — Fox Keller E. Language in action. Genes and metaphor of reading. Experimenting in tongues: Studies in science and language. Dorries M. (ed.). Stanford Univ. Press, 2002. Pp. 75—88.

49. Galik 2013 — Galik D. Biosemiotics: A new science of biology? Filozofia. 2013. Vol. 68. No. 10. Pp. 859—867.

50. Gamkrelidze 2009 — Gamkrelidze T. «Paradigms» in linguistics and the problem of the isomorphism between the genetic code & semiotic systems. Bulletin of the Georgian National Academy of Sciences. 2009. Vol. 3 (2). Pp. 194—197.

51. Gimona 2006 — Gimona M. Protein linguistics — a grammar for modular protein assembly? Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2006. Vol. 7. Pp. 68—73.

52. Gimona 2008 — Gimona M. Protein linguistics and the modular code of the cytoskeleton. Codes of Life. The Rules of Macroevolution. Barbieri M., Hoffmeyer J. (eds.). Biosemiotics. 2008. Vol. 1. Pp. 189—206

53. Hogeweg 2011 — Hogeweg P. The roots of Bioinformatics in theoretical Biology. PLoS Computational Biology. 2011. Vol. 7 (3).

54. Jacob 1977 — Jacob F. The linguistic model in biology. Roman Jakobson, echoes of his scholarship. Armstrong D., van Schooneveld C. H. (eds). 1977. Lisse: Peter de Ridder. Pp. 186—192.

55. Jaкobson 1970 — Jaкobson R. Linguistics. Relationship between the science of language and other sciences. Main trends of research in the social and human sciences. The Hague: Mouton, 1970. Pp. 419—453.

56. Ji 1997 — Ji S. Isomorphism between cell and human languages: molecular biological, bioinformatic and linguistic implications. Biosystems. 1997. Vol. 44 (1). Pp. 17—39.

57. Ji 1999 — Ji S. The linguistics of DNA: Words, sentences, grammar, phonetics, and semantics. Molecular strategies in biological evolution. Annals of the New York Academy of science. 1999. Vol. 870. Pp. 411—417.

58. Kull 1998 — Kull K. Organism as a self-reading text: anticipation and semiosis. International Journal of Computing Anticipatory Systems. 1998. Vol. 1. Pp. 93—104.

59. Kull 2002 — Kull K. A sign is not alive — a text is. Sign Systems Studies. 2002. Vol. 30 (1). Pp. 327—336.

60. Kull 2003 — Kull K. Thomas A. Sebeok and biology: Building biosemiotics. Cybernetics and Human Knowing. 2003. Vol. 10 (1). Pp. 47—60.

61. Kull et al. 2009 — Kull K., Deacon K., Emmeche C., Hoffmeyer J., Stjernfelt F. Theses on Biosemiotics: Prolegomena to a theoretical biology. Biological Theory. 2009. Vol. 4 (2). Pp. 167—173.

62. Pattee 2005 — Pattee H. H. The necessity of Biosemiotics: Matter-symbol complementarity. The physics and metaphysics of Biosemiotics. Journal of Biosemiotics. 2005. Vol. 1 (1). Pp. 223—238.

63. Raible 2001 — Raible W. Linguistics and Genetics: Systematic parallels. Language typology and language universals. An international handbook. Haspelmath M., König E., Oesterreicher W., Raible W. (eds). Berlin: Walter de Gruyter, 2001. Pp. 103—123.

64. Rothschild 1962 — Rothschild F. S. Laws of symbolic mediation in the dynamics of self and personality. Annals of the New York Academy of Sciences. 1962. Vol. 96 (3). Pp. 774—784.

65. Searls 1993 — Searls D. The computational linguistics of biological sequences. Artificial intelligence and molecular biology. Menlo Park (CA): AAAI Press, 1993. Pp. 47—120.

66. Searls 1999 — Searls D. Formal language theory and biological macromolecules. Mathematical support for molecular biology. American Mathematical Society Press. 1999. Pp. 117—140.

67. Searls 2002 — Searls D. B. The language of genes. Nature. 2002. Vol. 420 (6912). Pp. 211—217.

68. Searls 2010 — Searls D. B. Molecules, languages and automata. Grammatical Inference: Theoretical Results and Applications Lecture Notes in Computer Science. 2010. Vol. 6339. Pp. 5—10.

69. Stjernfelt 2002 — Stjernfelt F. Tractatus Hoffmeyerensis: Biosemiotics as expressed in 22 basic hypotheses. Sign Systems Studies. 2002. Vol. 30 (1). Pp. 337—345.

70. Suhr 2002 — Suhr St. Is the notion of language transferable to the genes? Experimenting in Tongues: Studies in science and language. Dörries M. (ed.). Stanford Univ. Press, 2002. Pp. 49—75.

71. Trifonov 2000 — Trifonov E. Earliest pages of bioinformatics. Bioinformatics. 2000. Vol. 16 (1). Pp. 5—9.

72. Trifonov 2008 — Trifonov E. Codes of biosequences. Codes of life. The rules of macroevolution. Barbieri M., Hoffmeyer J. (eds.). Biosemiotics. 2008. Vol. 1. Pp. 3—14.

73. Trifonov 2011 — Trifonov E. Thirty years of multiple sequence codes. Genomics. Proteomics & Bioinformatics. 2011. Vol. 9 (1—2). Pp. 1—6.

74. Venter et al. 2001 — Venter C. et al. The sequence of the human genome. Science. 2001. Vol. 291 (5507). Pp. 1304—1351.

75. Watson et al. 2001 — Watson J. et al. International Human Genome Sequencing Consortium. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. 2001. Vol. 409. Pp. 860—921.